Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Snf8Q9CZ28 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snf8Q9CZ28 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms