Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CXL3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9CXL3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CXL3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CXL3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CXL3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CXL3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CXL3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms