Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yif1bQ9CX30 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yif1bQ9CX30 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms