Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RpainQ9CWY9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms