Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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