Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT7

Desi1, Desumoylating isopeptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Desi1Q9CQT7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Desi1Q9CQT7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Desi1Q9CQT7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms