Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PompQ9CQT5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms