Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpb2Q9CQI7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms