Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQF4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQF4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQF4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CQF4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CQF4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CQF4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CQF4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQF4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQF4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQF4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CQF4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms