Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nipsnap3bQ9CQE1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms