Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp6v0e1Q9CQD8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Atp6v0e1Q9CQD8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Atp6v0e1Q9CQD8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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