Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbpbQ9CQC0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TpbpbQ9CQC0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TpbpbQ9CQC0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TpbpbQ9CQC0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TpbpbQ9CQC0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TpbpbQ9CQC0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TpbpbQ9CQC0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TpbpbQ9CQC0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TpbpbQ9CQC0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TpbpbQ9CQC0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TpbpbQ9CQC0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TpbpbQ9CQC0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TpbpbQ9CQC0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TpbpbQ9CQC0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TpbpbQ9CQC0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TpbpbQ9CQC0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TpbpbQ9CQC0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TpbpbQ9CQC0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TpbpbQ9CQC0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TpbpbQ9CQC0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TpbpbQ9CQC0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TpbpbQ9CQC0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TpbpbQ9CQC0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TpbpbQ9CQC0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TpbpbQ9CQC0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms