Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms