Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mid1ip1Q9CQ20 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms