Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms