Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930519G04RikQ9CPT7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms