Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl17Q9CPR4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl17Q9CPR4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms