Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms