Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab27bQ99P58 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rab27bQ99P58 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rab27bQ99P58 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab27bQ99P58 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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