Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep41Q99NF3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms