Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcgf6Q99NA9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcgf6Q99NA9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms