Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mrpl3Q99N95 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Mrpl3Q99N95 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Mrpl3Q99N95 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Mrpl3Q99N95 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Mrpl3Q99N95 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Mrpl3Q99N95 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Mrpl3Q99N95 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Mrpl3Q99N95 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl3Q99N95 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Mrpl3Q99N95 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mrpl3Q99N95 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mrpl3Q99N95 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl3Q99N95 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl3Q99N95 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl3Q99N95 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl3Q99N95 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl3Q99N95 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl3Q99N95 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl3Q99N95 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl3Q99N95 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl3Q99N95 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl3Q99N95 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl3Q99N95 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl3Q99N95 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl3Q99N95 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl3Q99N95 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl3Q99N95 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl3Q99N95 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl3Q99N95 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl3Q99N95 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl3Q99N95 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl3Q99N95 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Mrpl3Q99N95 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl3Q99N95 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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