Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramel1Q99MW3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms