Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp1b4Q99ME6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp1b4Q99ME6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms