Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gins4Q99LZ3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms