Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk5rap3Q99LM2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk5rap3Q99LM2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms