Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnpo2Q99LG2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms