Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmp1Q99KU0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmp1Q99KU0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms