Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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