Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp11Q99K46 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp11Q99K46 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms