Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdcbp2Q99JZ0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdcbp2Q99JZ0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms