Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krcc1Q99JT5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Krcc1Q99JT5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms