Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfxn1Q99JR1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfxn1Q99JR1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sfxn1Q99JR1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sfxn1Q99JR1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sfxn1Q99JR1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sfxn1Q99JR1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfxn1Q99JR1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms