Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ddb2Q99J79 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms