Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctu1Q99J10 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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