Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc8b1Q925Q3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms