Protein–RNA interactions for Protein: Q925I1

Atad3, ATPase family AAA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad3Q925I1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atad3Q925I1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms