Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Letmd1Q924L1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms