Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Alpk3Q924C5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Alpk3Q924C5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms