Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrif1Q923B3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms