Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tubb6Q922F4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb6Q922F4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms