Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Afg3l1Q920A7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Afg3l1Q920A7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Afg3l1Q920A7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Afg3l1Q920A7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Afg3l1Q920A7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Afg3l1Q920A7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Afg3l1Q920A7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Afg3l1Q920A7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Afg3l1Q920A7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Afg3l1Q920A7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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