Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc5a4bQ91ZP4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc5a4bQ91ZP4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc5a4bQ91ZP4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc5a4bQ91ZP4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc5a4bQ91ZP4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc5a4bQ91ZP4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc5a4bQ91ZP4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc5a4bQ91ZP4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc5a4bQ91ZP4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms