Protein–RNA interactions for Protein: Q91W67

Ubl7, Ubiquitin-like protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl7Q91W67 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubl7Q91W67 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubl7Q91W67 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubl7Q91W67 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubl7Q91W67 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubl7Q91W67 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubl7Q91W67 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubl7Q91W67 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubl7Q91W67 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubl7Q91W67 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubl7Q91W67 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubl7Q91W67 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubl7Q91W67 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubl7Q91W67 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubl7Q91W67 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubl7Q91W67 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubl7Q91W67 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubl7Q91W67 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubl7Q91W67 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms