Protein–RNA interactions for Protein: Q91W29

Cox4i2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i2Q91W29 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox4i2Q91W29 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms