Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tdrd3Q91W18 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tdrd3Q91W18 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms