Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn8Q91VA3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms