Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHT7

Gtf3a, Transcription factor IIIA, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3aQ8VHT7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3aQ8VHT7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms