Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rhbdd2Q8VEK2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rhbdd2Q8VEK2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rhbdd2Q8VEK2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rhbdd2Q8VEK2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Rhbdd2Q8VEK2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rhbdd2Q8VEK2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd2Q8VEK2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms