Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Smg8Q8VE18 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Smg8Q8VE18 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Smg8Q8VE18 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Smg8Q8VE18 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Smg8Q8VE18 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Smg8Q8VE18 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Smg8Q8VE18 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Smg8Q8VE18 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Smg8Q8VE18 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Smg8Q8VE18 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Smg8Q8VE18 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smg8Q8VE18 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smg8Q8VE18 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smg8Q8VE18 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smg8Q8VE18 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smg8Q8VE18 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smg8Q8VE18 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smg8Q8VE18 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smg8Q8VE18 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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